Как происходит конвертация fat32 в ntfs?

Если раздел винчестера отформатирован в FAT32, а требуется перейти к файловой системе NTFS без потери данных, то следует выполнить команду convert <диск:> /FS:NTFS

Например, для преобразования диска c: из  FAT32 в NTFS следует выполнить  convert c: /FS:NTFS

Получить справку по утилите convert можно выполнив  convert /?

Преобразование файловой системы тома FAT в NTFS.

CONVERT том: /FS:NTFS [/V] [/CvtArea:имя_файла] [/NoSecurity] [/X]

том         Определяет букву диска (с последующим двоеточием), точку подключения или имя тома.
/FS:NTFS    Конечная файловая система: NTFS.
/V          Включение режима вывода сообщений.
/CVTAREA:имя_файла Указывает непрерывный файл в корневой папке для резервирования места для системных файлов NTFS.
/NoSecurity Параметры безопасности для преобразуемых файлов и папок будут доступны для изменения всем.
/X          Принудительное снятие этого тома (если он был подключен). Все открытые дескрипторы этого тома станут недопустимыми.